Lloyd Aéreo Boliviano y Aerosur son las dos compañías aéreas que conectan varias ciudades de Bolivia.

Existen además algunas empresas tales como Transporte Aéreo Militar, SAVE y Amaszonas que cubren rutas entre poblaciones menores por ejemplo Rurrenabaque, Puerto Suárez, Riberalta, Yacuiba, Villamontes, San Borja, Reyes y Potosí para llegar a Uyuni.

Próximamente dos nuevas líneas aéreas llegarán al Aeropuerto Internacional de El Alto Lan Perú y Air Madrid.